Az AmigaOS egyfelhasználós operációsrendszer, amely az Exec nevű multitaszk kernelre épül. Assembly, BCPL, valamint C nyelven íródott és zárt forráskódú. Része az AmigaDOS(Amiga disk operating system), az Intuition elnevezésű API, mely a modern ablakokon alapuló felületet támogatja, egy asztali fájlkezelő (Workbench). A rendszerbe integrált parancssor, az AmigaShell szintén teljesen az ablakokra támaszkodik. A CLI és a Workbench ugyanazokkal a privilégiumokkal rendelkeznek. Fontos megemlíteni, hogy az AmigaOS nem rendelkezik semmilyen beépített memóriavédelmi funkióval.
Az AmigaOS az Amiga számítógépekre fejlesztett operációs rendszer. Elsőként a Commodore International cég fejlesztette (1.0-3.1) 1985-ös indulásától, majd a Haage & Partner (3.5-3.9) és végül a Hyperion Entertainment kezébe került (4.0-4.1), aki napjainkban is felelős érte.
Az OS két legfőbb komponense a firmware(Kickstart) és egy szoftverkomponens, amire legtöbbször csak Workbench néven utalnak. A 3.1-es verzióig ezek általában együtt jelentek meg, ám a 3.5-ös verzió óta a Commodore hanyatlásával csak a Workbench-et frissítették, a Kickstart jelentősége pedig háttérbe szorult. Firmware frissítések még mindig telepíthetőek a rendszer indítása alatt.
A Kickstart egy bootstrap firmware, amely a ROM-ban helyezkedik el. A Kickstart felelős az Amiga hardver és az OS főbb komponenseinek indításáért. Szerepe hasonlít a BIOS és a kernel szerepére az IBM PC és hozzá hasonló gépekben, ám ezen felül rengeteg plusz ún. "boot time" funkcionalitással is rendelkezik, a PC-kkel ellentétben, pl: Kickstart esetében már boot közben elérhető a teljes ablakinterfész. A Kickstart tartalmazza az OS főbb részeit is, mint az Exec-et, az Intuitiont, az AmigaDOS funkcionalitásának magját, valamint illesztőprogramokat, kontrollereket. Indításkor a Kickstart diagnosztikákat futtat, majd inicializálja az Amiga chipsetet és az OS központi funkcióit, ezután elindítja a legnagyobb prioritású boot eszközről a bootblockot, vagy amennyiben nem talál ilyet figyelmezteti erről a felhasználót.
A Workbench az Amiga natív grafikus felhasználói felülete, mely az AmigaOS-en fut. Nem szükséges betöltve lennie szoftverek futtatásához, sőt, egyes programok közvetlenül a Kickstartból indulnak, hogy kihasználhassák a teljes hardvert és minden erőforrást egymaguk. Amint azt a neve is sugallja, egy munkaasztal metaforáját valósítja meg. Ennek megfelelően az ikonok is fiókok, szerszámok és projektek, valamint kütyük. Az interfész hasonlít sok mai operációs rendszerére, vagyis van egy fő "asztal", melyen ikonok helyezkednek el, és egy menüsor a képernyő tetején. Már a korai Amigák is kétgombos egereket használtak, melynek jobbgombja nyitotta meg a legördülő menüket és a gomb eleresztésével választhattuk ki a menüpontokat. Az OS egyik jellegzetessége a több képernyő támogatása, melyek külön felbontással és színmélységgel rendelkezhetnek, mozgathatóak, vagy egy kütyü segítségével válogathatunk köztük. Az összes képernyőt tárolja a memória, ezért a köztük való váltogatás gond nélkül minimális idő alatt megtehető. A Workbench az Intuition rendszerére épül, amely kezeli a képernyők kirajzolását, az ablakokat, a fő input- és output eszközöket és a programok közötti kommunikációért is felelős.